В цивопедии вроде довольно неплохо все расписано про шпионаж, жаль только, что без конкретных цифр.
есть проект Оперативная поддержка, снижает риск раскрытия агента за каждого агента в штабе.
есть проект Рекогносцировка операций , повышает шанс успеха операции за каждого агента в штабе.
Без конкретных цифр ничего не скажешь , но есть предположение что эти проценты мизерные как и в случае гражданских проектов на здоровье/защиту/производство - 1-2%. ради этого смысла держать агентов в штабе точно не стоит , если есть города куда их рассадить, но если по игре на карте городов мало, то вполне возможен избыток агентов, тогда Рекогносцировка выглядит предпочтительней.
Ранг агента в штабе ни на что не влияет.
Ранг агентов в городе влияет на шанс раскрытия , доступные сведения о городе и на снижение интриги, если он в родном городе.На мой взгляд все это малосущественно, поэтому и смысла выбирать проект Оперативной поддержки не вижу, агент новичок ничем не хуже спецагента в плане выполнения операции, да и убивают их только когда интрига выше 3х кажется.
Вообще шпионаж в Civ:BE то немногое , что является шажком вперед по сравнению с цив5. Но тут можно былоб и дальше пойти, завязать шпионаж на производство и/или науку, как пример это было в Master of Orion сделано.